5 Pondok Terbesar di Indonesia 

1.Pondok Pesantren Sidogiri, Pasuruan

Sidogiri didirikan oleh seorang Sayyid dari Cirebon Jawa Barat bernama Sayyid Sulaiman

Terdapat dua versi tentang tahun berdirinya Pondok Pesantren Sidogiri yaitu 1718 atau 1745. Dalam suatu catatan yang ditulis Panca Warga tahun 1963 disebutkan bahwa Pondok Pesantren Sidogiri didirikan tahun 1718. Catatan itu ditandatangani oleh Almaghfurlahum KH Noerhasan Nawawie, KH Cholil Nawawie, dan KA Sa’doellah Nawawie pada 29 Oktober 1963.Dalam surat lain tahun 1971 yang ditandatangani oleh KA Sa’doellah Nawawie, tertulis bahwa tahun tersebut (1971) merupakan hari ulang tahun Pondok Pesantren Sidogiri yang ke-226. Dari sini disimpulkan bahwa Pondok Pesantren Sidogiri berdiri pada tahun 1745. Dalam kenyataannya, versi terakhir inilah yang dijadikan patokan hari ulang tahun/ikhtibar Pondok Pesantren Sidogiri

Kegiatan di Pondok Pesantren Sidogiri (PPS) dibagi menjadi dua macam, yaitu kegiatan Ma’hadiyah dan kegiatan Madrasiyah. Kegiatan Ma’hadiyah adalah kegiatan yang harus diikuti seluruh santri yang mukim di PPS. Sedangkan kegiatan Madrasiyah adalah kegiatan yang harus diikuti seluruh santri yang mukim di PPS dan murid yang sekolah dari rumah walinya, sesuai dengan tingkatan madrasah masing-masing. setiap akhir tahun pelajaran.

Salah satu kegiatan ekstra yang menjadi unngulan di Pondok Pesantren Sidogiri adalah kegiatan Annajah Center Sidogiri.

2.Mahad Az zaytun (Indramayu)

Ma'had Al-Zaytun adalah sebuah Pondok pesantren yang terletak di desa Mekar Jaya, kecamatan Gantar, kabupaten Indramayu, Jawa Barat. Pesantren yang dibangun pada 13 Agustus 1996

Ponpes yang disebut oleh Washington Times (29 Agustus 2005) sebagai pesantren terbesar se-Asia Tenggara ("the largest Islamic madrasah in Southeast Asia")[3] ini berdiri di atas lahan seluas 1200 hektar. kurikulumnya yaitu,ponpes yang memiliki landasan yaitu "Pesantren spirit but modern system" ini menggunakan kurikulum yang mengacu pada Kementerian Agama dan Kementerian Pendidikan dan Kebudayaan

3.Pondok Pesantren Modern Gontor (Ponorogo)

Pesantren yang terletak di Ponorogo, Jawa Timur ini adalah salah satu pesantren terbaik dan terbesar yang ada di Indonesia. Pondok pesantren modern Gontor telah berdiri sejak 10 April 1926 oleh tiga bersaudara dari putra Kiai Santoso Anom Besari, yaitu KH Zainudin Fananie, KH Ahmad Sahal, dan KH Imam Imam Zarkasy.

Kurikulum Gontor menerapkan konsep pendidikan asrama (boarding school) yang memadukan model pesantren klasik/salaf dengan kurikulum modern.Jumlah santri± 25.000.Jumplah ektrakulikuler sekitar 11 ektrakulikuler

4.Pondok Pesantren Langitan (Tuban)

Pondok Pesantren Langitan adalah salah satu lembaga pendidikan Islam tertua di Indonesia. Berdirinya lembaga ini jauh sebelum Indonesia merdeka yaitu tepatnya pada tahun 1852, di Dusun Mandungan, Desa Widang, Kecamatan Widang, Kabupaten Tuban, Jawa Timur. Komplek Pondok Pesantren Langitan terletak di samping bengawan Solo dan berada di atas areal tanah seluas kurang lebih 7 hektar

5.Pondok Pesantren Lirboyo (Kediri)

Pondok Pesantren Lirboyo didirikan oleh KH. Abdul Karim pada tahun 1910 M,yang saat ini diasuh oleh KH. M. Anwar Manshur, terletak di Lirboyo, Kec. Mojoroto, Kota Kediri serta berafiliasi kepada Nahdlatul Ulama dan tetap menjadi pesantren salaf, yakni pesantren yang menekankan pada kemampuan membaca dan mengkaji kitab-kitab salaf (kitab kuning) untuk pembelajaran sehari-hari. Pesantren ini menjadi salah satu pusat studi Islam sejak puluhan tahun sebelum kemerdekaan Indonesia. Lembaga pendidikan ini adalah penampung siswa, mahasiswa dan mahasiswi yang belajar dibawah naungan Yayasan Pendidikan Islam Tribakti (YPIT). Pondok pesantren ini sendiri memiliki beberapa lembaga: PP Lirboyo HM Al-Mahrusiyah Putra/Putri, Madrasah Diniyah Al-Mahrusiyah, Madrasah Murottilil Qur’an Al-Mahrusiyah, Institut Agama Islam Tribakti (IAIT), Madrasah Aliyah HM Tribakti, Madrasah Tsanawiyah HM Tribakti, TK Kusuma Mulia Tribakti, koperasi Pondok Pesantren dan perpustakaan Pondok Pesantren.